از مهم‌ترین رسالت‌های گروه مهندسی بهداشت محیط می‌توان به موارد زیر اشاره کرد:

1- ایفای نقش موثر جهت ارتقاء سطح به داشت و حل مشکلات زیست محیطی در قالب کار گروهی

2- شناسائی عملیات و فرایندهای فیزیکی، شیمیائی و زیستی به منظور بهسازی محیط

3- شناخت و بکارگیری وسایل، تجهیزات سنجش و اندازه گیری آلاینده‌ها

4- طراحی سیستم‌های تصفیه و کنترل آلاینده‌ها در آب، فاضلاب و هوا و مواد زائد جامد

5- آشنائی با روش‌های ارزشیابی، پایش و مدیریت بهداشت محیط و محیط زیست

6- شناخت قوانین، استانداردها و برنامه‌های کنترل آلودگی

7- تولید علم در جهت پیشرفت ایران اسلامی

8- گسترش تحقیقات و اولویت بندی فعالیت‌های پژوهشی در مسائل و مشکلات محیط زیستی و تلاش جهت ارائه راهکارهای مناسب

9- پرورش و تربیت دانش آموختگانی با بالاترین کیفیت علمی و عملی ممکن


ارزش ها و باورهای متخصصین رشته مهندسی بهداشت محیط:
بر اساس تعالیم عالیه دین مبین اسلام در زمینه جایگاه انسان در خلقت و توجه به کرامت والای انسانی و بر اساس بند 12 اصل سوم، اصل بیست و نهم و بند اول اصل چهل و سوم قانون اساسی جمهوری اسلامی ایران مبنی بر تامین بهداشت جامعه و پی‌ریزی اقتصادی صحیح در زمینه بهداشت و همچنین اصل پنجاهم قانون اساسی جمهوری اسلامی در زمینه حفاظت از محیط زیست، متخصصین این رشته باور دارند که حفاظت از محیط زیست یک وظیفه انسانی، اخلاقی و دینی می‌باشد.
شته بهداشت محیط تشکیل شده است تا با توجه به ارزش‌های حاکم بر جامعه و مقررات، قوانین، استانداردهای موجود و بر اساس دستاوردها، پیشرفت‌ها و تحولات منطقه‌ای و بین المللی برنامه‌های آموزشی جوانان مستعد و لایق کشور را در این زمینه و تخصصی ارائه نماید. دانش آموختگان این رشته افراد متعهد، متخصص و کارآمدی هستند که قادرند شناسائی، پیشگیری و کنترل آلاینده‌های محیطی را از طریق بر نامه ریزی طراحی، مدیریت، آموزش و اجرا در سطح مطلوبی انجام دهند.